三门境内有海游港、健跳港、旗门港、浦坝港、洞港等五大港口,水运条件优越,港口沿岸腹地辽阔。
健跳港是浙江省三大深水良港之一,为省定台轮停泊点,全长17公里,水深9—47米,港面宽度为300—800米,港水含泥沙少,平均风力2—3级,是不冻、不淤、避风的天然良港。
健跳港南北两翼浅海滩涂开阔,围涂面积可达23000亩,港区内拥有丰富的电力资源,淡水、场地、地质、环保等条件优越,规划面积18余平方公里的浙江三门临港型工业园区开发正有序进行。